Posterior a una historia clínica y examen físico detallado completo, el diagnóstico confirmatorio para endometriosis profunda y en ocasiones superficial se realiza mediante la ecografía especializada llamada ecografía de mapeo para endometriosis, este tipo de imágenes se debe realizar con equipos de alta resolución y por especialistas debidamente capacitados y familiarizados con esta patología.

Este método diagnóstico nos ayuda a identificar cada uno de los nódulos presentes en la pelvis y algunas por fuera de ella. En algunos casos especiales las pacientes deberán someterse a otros estudios como la resonancia de pelvis o de la vía urinaria.